Filem Contact yang dikeluarkan pada 1997, berdasarkan daripada novel Sagan dengan judul sama dan disiapkan selepas kematiannya, diakhiri dengan belasungkawa "For Carl" (Untuk Carl). Gambarnya boleh dilihat pada 59:23 di dalam filem ini.

Pada 1997, Sagan Planet Walk telah dibuka di Ithaca, New York. Ia merupakan model skala berjalan ke Sistem Suria, mengekalkan 1.2 km dari pusat The Commons di pusat banda Ithaca kepada Sciencenter, sebuah muzium tangan. Pameran ini telah diwujudkan sebagai ingatan untuk Carl Sagan, yang menetap di Ithaca dan Profesor Cornell. Profesor Sagan telah menjadi ahli pengasas lembaga penasihat muzium berkenaan.[99]

Tapak pendaratan kapal angkasa Mars Pathfinder tidak bernama telah dinamakan Stesen Peringatan Carl Sagan pada 5 Julai 1997. Asteroid 2709 Sagan telah dinamakan sebagai memperingati jasa beliau, dan Institut Carl Sagan untuk pencarian planet berhabitat.

Anak lelaki Sagan, Nick, menulis beberapa episod dalam francais Star Trek. Di dalam episod Star Trek: Enterprise bertajuk "Terra Prime", pukulan cepat ditunjukkan daripada perayau relik Sojourner, sebahagian daripada misi Mars Pathfinder, diletakkan oleh penanda sejarah di Stesen Memorial Carl Sagan di permukaan Marikh. Penanda itu memaparkan petikan dari Sagan: "Apa pun sebabnya anda berada di Marikh, saya gembira anda berada di sana, dan saya berharap saya bersama anda." Pelajar Sagan Steve Squyres mengetuai pasukan yang membawa Spirit dan Opportunity dengan jayanya di Marikh pada 2004. 

Pada 9 November 2001, mengenai apa yang akan menjadi ulang tahun ke-67 Sagan, Pusat Penyelidikan Ames mendedikasikan tapak untuk Pusat Carl Sagan untuk Kajian Kehidupan di Kosmos. "Carl adalah seorang penglihatan yang luar biasa, dan kini warisannya dapat dipertahankan dan maju dengan penyelidikan dan makmal pendidikan abad ke-21 yang komited untuk meningkatkan pemahaman kita tentang kehidupan di alam semesta dan memajukan punca penerokaan ruang angkasa untuk sepanjang masa", kata pentadbir NASA Daniel Goldin. Ann Druyan berada di Pusat itu ketika ia membuka pintu pada 22 Oktober 2006.

Sagan mempunyai sekurang-kurangnya tiga anugerah yang dinamakan sempena nama beliau:

• Anugerah Peringatan Carl Sagan yang disampaikan secara bersama sejak tahun 1997 oleh Persatuan Astronomi Amerika dan Persatuan Planetarium,
• Pingat Carl Sagan untuk Kecemerlangan dalam Komunikasi Awam dalam Sains Planet yang dibentangkan sejak 1998 oleh Persatuan Astronomi Amerika bagi Sains Planet (AAS/DPS) untuk komunikasi cemerlang oleh saintis planet aktif kepada orang awam—Carl Sagan ialah salah satu penganjuran yang asal ahli jawatankuasa DPS, dan
• Anugerah Carl Sagan bagi Pemahaman Awam Sains yang disampaikan oleh Majlis Presiden Saintifik Persatuan (CSSP)—Sagan merupakan penerima pertama dari penghargaan CSSP pada tahun 1993.

Ogos 2007 Kumpulan Penyiasatan Bebas (IIG) menganugerahkan Sagan anugerah Pencapaian Sepanjang Hayat secara anumerta. Penghargaan ini juga telah dianugerahkan kepada Harry Houdini dan James Randi.[100]

Bermula pada tahun 2009, sebuah projek muzik yang dikenali sebagai Symphony of Science mencontoh beberapa petikan Sagan dari siri Cosmos dan menyalinnya kepada muzik elektronik. Setakat ini, video telah menerima lebih 21 juta paparan di seluruh dunia di YouTube.[101]

Filem pendek cereka sains sains Sweden Wanderers menggunakan petikan-petikan mengenai riwayat Sagan dari bukunya Pale Blue Dot, yang dimainkan secara visual yang diciptakan secara visual perkembangan masa depan manusia di dalam ruang angkasa.[102][103]

Pada Februari 2015, band metal yang berpusat di Finland Nightwish melancarkan lagu "Sagan" sebagai trek bonus album tanpa album untuk single mereka "Élan".[104] Lagu yang ditulis oleh penulis lagu/komposer/keyboardis band Tuomas Holopainen, ialah penghormatan kepada kehidupan dan kerja mendiang Carl Sagan.

Pada Ogos 2015, ia telah diumumkan bahawa biopik kehidupan Sagan sedang dirancang oleh Warner Bros.[105]